鞣酸苦参碱胶囊和酪酸梭菌二联活菌散通常可以一起服用，但是患者需要在医生的指导下应用。鞣酸苦参碱胶囊为止泻药，用于急慢性肠炎、溃疡性结肠炎引起的腹泻。酪酸梭菌二联活菌散用于急性非特异性感染引起的急、慢性腹泻。两种药物没有配伍禁忌，一起服用不会降低药物的疗效，也不会对疾病的恢复造成影响，所以可以一起服用。
益生菌一般不建议和药一起吃，可能会影响益生菌的疗效。
益生菌一般是活菌制剂，跟一些药物同时服用会出现疗效。比如跟抗生素同服会杀死活菌甚至出现不良反应。益生菌用于细菌或真菌引起的急、慢性肠炎、腹泻。也可用于其他原因引起的肠道菌群失调的防治。建议整个吞服，对吞咽困难者，服用时可打开胶囊，将药粉加入少量温水或奶液混合后服用。切勿将本品置于高温处，溶解时水温不宜超过40℃。避免与抗菌药同服，必要时需间隔3小时服用。
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